Năm đối tượng mà Quỹ Mekong Xanh sẽ ưu tiên hỗ trợ bao gồm:
1. Những gia đình nông dân, ngư dân và con em của họ đang trong hoàn cảnh khó khăn
2. Đồng bào dân tộc vùng sâu, vùng xa, những người còn thiếu bữa ăn và con em không được học hành
3. Những dự án sáng tạo thúc đẩy nuôi trồng và sản xuất theo hướng bền vững và bảo vệ môi trường
4. Những người già neo đơn, những người vô gia cư và những hoàn cảnh đặc biệt khó khăn trong đời thường
5. Cứu trợ khẩn cấp người dân trong những vùng bị thiên tai